Родился в селе Милюково Смоленской области. Окончил отделение естественных наук физико-математического факультета Петербургского университета. Был хранителем геологического кабинета университета, доцентом и профессором.

Мировую славу Докучаеву принесла монография «Русский чернозём», защищённая как докторская диссертация в 1883 году. В ней он впервые установил понятие о почве как особом естественном теле, образующемся при взаимодействии материнской породы, климата, растительности и животных, рельефа.

Под его руководством работало несколько крупных комплексных экспедиций по изучению почв России. В 1894 году Докучаев учредил первую в России кафедру почвоведения в Ново-Александрийском институте сельского хозяйства и лесоводства, реорганизовал систему преподавания в институте, которая стала образцом для реорганизации всего высшего сельскохозяйственного образования в стране.

Идеи Докучаева оказали большое влияние на развитие лесоведения, мелиорации, гидрогеологии, динамической геологии, физической географии, геоботаники, геоморфологии.

По материалам энциклопедического справочника «Имя на карте города».